TPPは３つの重要な酵素−ピルビン酸脱水素酵素・α‐ケトグルタル酸脱水素酵素・トランスケトラーゼ−の補欠分子族である。TPPを利用する酵素反応に共通する特徴は、活性型アルデヒド部分の転移である。
※補欠分子族…酵素や他のタンパク質が生理機能を発揮するために必要不可欠な強力な非ポリペプチド結合のこと。ミオグロビンやヘモグロビンに対するヘムが最も特徴的な例。
ピルビン酸脱水素酵素複合体は、ピルビン酸からアセチルCoAを生成する酸化的脱炭酸反応（解糖系の最終産物であるピルビン酸をクエン酸回路へ不可逆的に送り込む反応）を触媒する。
ピルビン酸 + CoA + NAD+ ―→ アセチルCoA + CO2 + NADH
α‐ケトグルタル酸脱水素酵素複合体は、クエン酸回路内におけるα‐ケトグルタル酸の酸化的脱炭酸反応を触媒する。
α‐ケトグルタル酸 + CoA + NAD+ ―→ スクニシルCoA + CO2 + NADH
トランスケトラーゼは、糖から糖へ２炭素単位を転移する酵素で、３炭素単位を転移するトランスアルドラーゼとともに、以下の３つの反応を触媒して、ペントースリン酸回路と解糖系との間に可逆的な連結を作り出す。なお、２個または３個の炭素単位を供与する糖は常にケトースであり、受容体は常にアルドースである。
※シッフ塩基…第１級アミンがアルデヒドやケトンと反応する際に生じるイミン（-N+H=C=）。
※ピロール環…活性化された金属原子を含む多くの重要な生体内の色素・構造体に見られる環状構造。
コバラミン酵素は３種の反応を触媒する。@分子内の配置変え、Aメチオニン合成に見られるようなメチル化、Bリボヌクレオチドのデオキシリボヌクレオチドへの還元である。哺乳類で補酵素B12を必要とする反応は、非極性アミノ酸分解で見られるL-メチルマロニルCoAのスクシニルCoAへの変換（分子内の配置変え）と、ホモシステインのメチル化によるメチオニン生成のみである。
コバラミンが関連した代謝疾患には、悪性貧血とメチルマロン酸尿症などがある。これらの詳細については、前期分（21）参照。
結合組織の主要なタンパクであるコラーゲンの３重らせん構造には、他ではめったに見られないアミノ酸の１種である4‐ヒドロキシプロリンが存在する。このめずらしいアミノ酸は次のように作られる。できたばかりのコラーゲン鎖にあるグリシン残基のアミノ基側のプロリン残基の４位の炭素に、O2由来の酸素原子が連結する。O2のもう１つの酸素原子は、α-ケトグルタル酸に取り込まれ、これがコハク酸に変換される。この複雑な反応は、Fe2+が固く結合したプロリン水酸化酵素（２原子酸素添加酵素の１種）によって触媒される。この酵素はまた、プロリンのヒドロキシル化なしにα-ケトグルタル酸をコハク酸に変換するが、この部分的な反応ではプロリン水酸化酵素が不活化される。ここで、活性型のプロリン水酸化酵素を再生するために、アスコルビン酸（ビタミンC）が特異的な抗酸化剤として働くのである。
霊長類やモルモットはアスコルビン酸を生合成することはできないので、食物から摂取しなければならない。アスコルビン酸欠乏症には、壊血病がある。ヒドロキシプロリンが、鎖間に水素結合をつくコラーゲンの３重らせんを安定化させるため、生体内でアスコルビン酸のない条件下で合成されたコラーゲンは、正常なものに比べて融点が低い。そのため、ヒドロキシル化が不十分だと、そうしたコラーゲンによって異常な繊維がつくられ、皮膚の病変や血管のもろさが露呈するようになる。ひどい場合には、足で立つことさえできなくなるという。
ニコチン酸はトリプトファンからつくられる。食物からのトリプトファン供給が十分な場合、ヒトは必要量のニコチン酸を合成することができるが、食物からのトリプトファン摂取量が少ない場合は、外からのニコチン酸の供給が必要になる。食物からのトリプトファンとニコチン酸の供給が不足すると、皮膚炎や下痢、痴呆などを症状とするペラグラという病気を引き起こす。